Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CHSY3Q70JA7 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CHSY3Q70JA7 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
CHSY3Q70JA7 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.3 ms