Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
E2F4Q16254 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
E2F4Q16254 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
E2F4Q16254 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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