Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
GRIK4Q16099 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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GRIK4Q16099 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GRIK4Q16099 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GRIK4Q16099 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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