Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKIV2LQ15477 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SKIV2LQ15477 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SKIV2LQ15477 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
SKIV2LQ15477 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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