Protein–RNA interactions for Protein: Q15049

MLC1, Membrane protein MLC1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLC1Q15049 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
MLC1Q15049 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
MLC1Q15049 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
MLC1Q15049 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.1 ms