Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SNX17Q15036 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNX17Q15036 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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SNX17Q15036 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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SNX17Q15036 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
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SNX17Q15036 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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SNX17Q15036 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNX17Q15036 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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