Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCARF1Q14162 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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