Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PEX6Q13608 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PEX6Q13608 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PEX6Q13608 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.2 ms