Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
NEUROD1Q13562 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NEUROD1Q13562 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NEUROD1Q13562 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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