Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
TCOF1Q13428 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
TCOF1Q13428 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TCOF1Q13428 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
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