Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RESTQ13127 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
RESTQ13127 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RESTQ13127 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RESTQ13127 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RESTQ13127 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RESTQ13127 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RESTQ13127 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
RESTQ13127 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RESTQ13127 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RESTQ13127 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RESTQ13127 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RESTQ13127 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RESTQ13127 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms