Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
GRIK2Q13002 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
GRIK2Q13002 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.9 ms