Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.79
HMGXB3Q12766 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.43□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.46□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
HMGXB3Q12766 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
HMGXB3Q12766 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
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