Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CENPFP49454 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-4.33□□□□□ -3.1
CENPFP49454 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-4.34□□□□□ -3.1
CENPFP49454 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CENPFP49454 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-4.35□□□□□ -3.11
CENPFP49454 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-4.36□□□□□ -3.11
CENPFP49454 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-4.37□□□□□ -3.11
CENPFP49454 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-4.38□□□□□ -3.11
CENPFP49454 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-4.39□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-4.4□□□□□ -3.11
CENPFP49454 RNU6-836P-201ENST00000362920 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC-4.41□□□□□ -3.12
CENPFP49454 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CENPFP49454 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CENPFP49454 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-4.42□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CENPFP49454 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-4.43□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC-4.44□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC-4.45□□□□□ -3.12
CENPFP49454 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-4.46□□□□□ -3.12
CENPFP49454 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
CENPFP49454 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
CENPFP49454 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-4.47□□□□□ -3.13
CENPFP49454 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
CENPFP49454 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-4.48□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-4.49□□□□□ -3.13
CENPFP49454 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CENPFP49454 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CENPFP49454 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-4.5□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
CENPFP49454 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-4.51□□□□□ -3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 243.8 ms