Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-2.51□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.57□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-2.58□□□□□ -2.82
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
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