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Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6
OPN4, Melanopsin, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
OPN4
Q9UHM6
hsa-mir-3130-1.1-201
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75 nt
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.773-201
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90 nt
BASIC
0.06
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-170P-201
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104 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORA42.1-201
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137 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP128-201
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116 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
0.05
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.488-201
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102 nt
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.555-201
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP272-201
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□□□□□ -2.4
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Q9UHM6
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Q9UHM6
RNU6-794P-201
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□□□□□ -2.4
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Q9UHM6
AL162376.1-201
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
MIR1255B1-201
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP214-201
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-571P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORD38.2-201
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.528-201
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108 nt
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
MIR519A1-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-735P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORD63B-201
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70 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU7-195P-201
ENST00000458793
62 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RPL39P34-201
ENST00000477141
156 nt
BASIC
0.04
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.809-201
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95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-781P-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU1-29P-201
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126 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
MIR548D2-201
ENST00000384955
97 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-127P-201
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107 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
SNORD41.1-201
ENST00000391000
69 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-850P-201
ENST00000516934
103 nt
BASIC
0.03
□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
AC104408.1-201
ENST00000605241
170 nt
BASIC
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□□□□□ -2.4
OPN4
Q9UHM6
RNU6-235P-201
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107 nt
BASIC
0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.170-201
ENST00000363746
110 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.180-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
SNORD114-9-201
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72 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
MIR643-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-269P-201
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97 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORA7.5-201
ENST00000410672
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BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU7-200P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1232P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-1265P-201
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Q9UHM6
RNU6-1061P-201
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-1234P-201
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OPN4
Q9UHM6
MIR4667-201
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
SNORA70.25-201
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OPN4
Q9UHM6
MIR499B-201
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73 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
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Q9UHM6
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MIR610-201
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OPN4
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OPN4
Q9UHM6
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OPN4
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MIR5706-201
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OPN4
Q9UHM6
MIR4768-201
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OPN4
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OPN4
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U7.6-201
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OPN4
Q9UHM6
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BASIC
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OPN4
Q9UHM6
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.507-201
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99 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
MIR516A2-201
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
MIR516A1-201
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90 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
SNORA40-201
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126 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
MIR501-201
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
MIR3920-201
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86 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
MTND5P18-201
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1801 nt
BASIC
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-1313P-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-509P-201
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107 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.155-201
ENST00000363632
101 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.344-201
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112 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
Y_RNA.568-201
ENST00000384742
113 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
AC006210.1-201
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111 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
SPINT5P-201
ENST00000448174
155 nt
BASIC
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□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-782P-201
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104 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-255P-201
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105 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
uc_338.28-201
ENST00000612082
187 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
ST7-AS2_1.1-201
ENST00000622900
72 nt
BASIC
-0.02
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
SNORD114-16-201
ENST00000363044
70 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
SNORD38.1-201
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68 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
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107 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-409P-201
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104 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
MIR593-201
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100 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
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88 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNU6-257P-201
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98 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
OPN4
Q9UHM6
RNA5SP484-201
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111 nt
BASIC
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Q9UHM6
RNU7-74P-201
ENST00000459104
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OPN4
Q9UHM6
RNU6-772P-201
ENST00000516042
105 nt
BASIC
-0.03
□□□□□ -2.41
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