Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
SMN1Q16637 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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