Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ECM1Q16610 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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ECM1Q16610 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ECM1Q16610 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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ECM1Q16610 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECM1Q16610 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
ECM1Q16610 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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ECM1Q16610 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
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ECM1Q16610 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ECM1Q16610 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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