Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
RAB30Q15771 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
RAB30Q15771 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.46□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
RAB30Q15771 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.8 ms