Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.9 ms