Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
NCAPHQ15003 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
NCAPHQ15003 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
NCAPHQ15003 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
NCAPHQ15003 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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