Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
NEDD9Q14511 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms