Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ERV3-1Q14264 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ERV3-1Q14264 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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