Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PKP1Q13835 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.57□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKP1Q13835 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms