Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
FHL3Q13643 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
FHL3Q13643 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.3 ms