Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
IRF5Q13568 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
IRF5Q13568 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
IRF5Q13568 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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