Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RLFQ13129 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RLFQ13129 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
RLFQ13129 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
RLFQ13129 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
RLFQ13129 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
RLFQ13129 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RLFQ13129 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RLFQ13129 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RLFQ13129 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RLFQ13129 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RLFQ13129 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.3 ms