Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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TRAF3Q13114 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
TRAF3Q13114 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRAF3Q13114 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRAF3Q13114 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
TRAF3Q13114 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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TRAF3Q13114 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
TRAF3Q13114 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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