Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
KCNMA1Q12791 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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KCNMA1Q12791 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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KCNMA1Q12791 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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KCNMA1Q12791 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
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KCNMA1Q12791 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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KCNMA1Q12791 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
KCNMA1Q12791 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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KCNMA1Q12791 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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KCNMA1Q12791 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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KCNMA1Q12791 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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KCNMA1Q12791 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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KCNMA1Q12791 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KCNMA1Q12791 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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