Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
J3QKU1 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
J3QKU1 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
J3QKU1 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.6 ms