Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN8AQ9UQD0 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SCN8AQ9UQD0 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
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