Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SH3BP4Q9P0V3 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SH3BP4Q9P0V3 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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