Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
NLRC3Q7RTR2 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.9 ms