Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
CHSY3Q70JA7 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CHSY3Q70JA7 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms