Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRNQ16849 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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PTPRNQ16849 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRNQ16849 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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PTPRNQ16849 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
PTPRNQ16849 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
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PTPRNQ16849 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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PTPRNQ16849 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
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PTPRNQ16849 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRNQ16849 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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