Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HIF1AQ16665 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
HIF1AQ16665 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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HIF1AQ16665 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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HIF1AQ16665 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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HIF1AQ16665 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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HIF1AQ16665 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HIF1AQ16665 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
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