Protein–RNA interactions for Protein: Q16637

SMN1, Survival motor neuron protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1Q16637 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMN1Q16637 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMN1Q16637 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMN1Q16637 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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