Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
TRAM1Q15629 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
TRAM1Q15629 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
TRAM1Q15629 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
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