Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.74□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
SHPRHQ149N8 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
SHPRHQ149N8 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
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