Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ODF1Q14990 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
ODF1Q14990 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
ODF1Q14990 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
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