Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RAB39AQ14964 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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RAB39AQ14964 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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RAB39AQ14964 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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RAB39AQ14964 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RAB39AQ14964 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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