Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.3
NEDD9Q14511 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.6□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
NEDD9Q14511 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
NEDD9Q14511 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
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