Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ERV3-1Q14264 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
ERV3-1Q14264 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.8 ms