Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.49□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.48□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
UBE4AQ14139 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
UBE4AQ14139 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
UBE4AQ14139 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186 ms