Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
COL9A3Q14050 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
COL9A3Q14050 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
COL9A3Q14050 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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