Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
PDE6HQ13956 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
PDE6HQ13956 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.5 ms