Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
PKP1Q13835 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
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PKP1Q13835 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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PKP1Q13835 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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PKP1Q13835 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKP1Q13835 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PKP1Q13835 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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PKP1Q13835 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PKP1Q13835 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
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PKP1Q13835 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKP1Q13835 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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