Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PKD2Q13563 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
PKD2Q13563 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
PKD2Q13563 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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