Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.47□□□□□ -2.64
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.51□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PPP1R1AQ13522 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1414.1 ms