Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
TCIRG1Q13488 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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TCIRG1Q13488 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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TCIRG1Q13488 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
TCIRG1Q13488 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
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TCIRG1Q13488 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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TCIRG1Q13488 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
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TCIRG1Q13488 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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TCIRG1Q13488 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TCIRG1Q13488 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TCIRG1Q13488 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
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TCIRG1Q13488 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCIRG1Q13488 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
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