Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TOP3AQ13472 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TOP3AQ13472 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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